2012年，南浔区参加新型农村合作医疗农民人数达34.75万人，参合率达98.24%，总筹资16677.07万元，其中农民出资5080.55万元，镇财政补助2041.95万元，区财政补助3196.44万元。有189.24万人次的参合农民享受"三条保障线"报销，累计报销金额达16103.55万元,人数受益率为72.57%。其中门诊1855441人次，报销4206.42万元；大病36667人次，报销11897.13万元。2012年全区新农合住院政策内补偿比例达71.48%，与2011年对比增长10.6%。门诊均次费用有了明显的下降，比上年度减少14.51元，减少率为19.32%。